在細(xì)胞這個(gè)微觀世界里,蛋白質(zhì)之間的相互作用是生命活動(dòng)的核心。如何在活細(xì)胞內(nèi)“親眼看見(jiàn)”這些互作過(guò)程?雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)(Bimolecular Fluorescence Complementation, BiFC)給出了答案。這項(xiàng)技術(shù)通過(guò)熒光蛋白的“片段重組”,讓原本沉默的熒光“點(diǎn)亮”蛋白質(zhì)互作的瞬間,成為研究蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)互作的直觀工具。本文結(jié)合最新研究進(jìn)展,詳解BiFC的原理、實(shí)驗(yàn)流程、優(yōu)劣勢(shì)及應(yīng)用案例,幫你輕松掌握這項(xiàng)“可視化”實(shí)驗(yàn)技術(shù)。
一、BiFC技術(shù)原理:熒光蛋白的“斷裂與重生”
雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)本質(zhì)上是一種蛋白質(zhì)片段互補(bǔ)技術(shù),是指將熒光蛋白多肽鏈在某些不保守的氨基酸處切開(kāi),形成不發(fā)熒光的 N-和 C-末端2 個(gè)多肽片段。將這 2 個(gè)熒光蛋白片段分別連接到 1 對(duì)能發(fā)生相互作用的目標(biāo)蛋白上,在細(xì)胞內(nèi)共表達(dá)或體外混合這 2 個(gè)融合蛋白時(shí),由于目標(biāo)蛋白質(zhì)的相互作用,熒光蛋白的 2 個(gè)片段在空間上互相靠近互補(bǔ),重新構(gòu)建成完整的具有活性的熒光蛋白分子,從而產(chǎn)生熒光

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1. 三大關(guān)鍵步驟
(1)熒光蛋白分割:從“完整發(fā)光”到“片段沉默”
選擇熒光蛋白的 柔性環(huán)區(qū)域切割(如YFP在155/156位氨基酸切割),形成N端(VN)和C端(VC)兩個(gè)片段。單獨(dú)存在時(shí),VN和VC無(wú)法折疊成活性結(jié)構(gòu),無(wú)熒光。
-常用熒光蛋白:YFP(激發(fā)514nm/發(fā)射527nm)、Venus(YFP突變體,熒光更強(qiáng))、mCherry(紅色熒光,多色實(shí)驗(yàn)首選)。
(2)融合蛋白設(shè)計(jì):目標(biāo)蛋白“攜帶”熒光片段
將VN與目標(biāo)蛋白A融合(VN-A),VC與目標(biāo)蛋白B融合(VC-B)。若A與B發(fā)生相互作用,VN和VC在空間上靠近(距離<10nm),觸發(fā)重組。
(3)熒光恢復(fù):互作發(fā)生的“信號(hào)燈”
重組后的熒光蛋白重建β-桶狀結(jié)構(gòu),發(fā)色團(tuán)(如YFP的Gln-Tyr-Gly)正確折疊,在特定激發(fā)光下發(fā)出熒光,通過(guò)顯微鏡直接觀察。
二、實(shí)驗(yàn)流程:從載體構(gòu)建到熒光觀察
BiFC實(shí)驗(yàn)需經(jīng)過(guò) “載體構(gòu)建-細(xì)胞轉(zhuǎn)染-熒光檢測(cè)” 三大步驟,關(guān)鍵在于排除假陽(yáng)性和確保熒光信號(hào)特異性。
1. 載體構(gòu)建:讓目標(biāo)蛋白“帶上”熒光片段
克隆目標(biāo)基因:將蛋白A基因插入含VN片段的載體(如pBiFC-VN173),蛋白B基因插入含VC片段的載體(如pBiFC-VC155),形成融合表達(dá)載體(VN-A和VC-B)。
對(duì)照載體設(shè)計(jì):
陰性對(duì)照:?jiǎn)为?dú)轉(zhuǎn)染VN-A或VC-B(驗(yàn)證無(wú)自發(fā)熒光);轉(zhuǎn)染VN-空載+VC-空載(排除片段自發(fā)重組)。
陽(yáng)性對(duì)照:轉(zhuǎn)染已知互作的蛋白對(duì)(如c-Myc/Max二聚體),確保實(shí)驗(yàn)體系有效。
2. 細(xì)胞轉(zhuǎn)染:讓融合蛋白在活細(xì)胞內(nèi)表達(dá)
選擇合適細(xì)胞:哺乳動(dòng)物細(xì)胞(如HEK293T、Hela)、植物原生質(zhì)體(如擬南芥、煙草)或酵母細(xì)胞均可。
共轉(zhuǎn)染:將VN-A和VC-B載體共轉(zhuǎn)染至細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)24-48小時(shí)(確保蛋白表達(dá))。
轉(zhuǎn)染效率驗(yàn)證:可通過(guò)載體上的報(bào)告基因(如GFP)或Western Blot檢測(cè)融合蛋白表達(dá)。
3. 熒光檢測(cè):捕捉互作的“閃光信號(hào)”
(1)顯微鏡觀察(最常用方法)
共聚焦激光掃描顯微鏡:在特定激發(fā)光下觀察(如YFP用514nm激發(fā),527nm發(fā)射),可直接看到熒光信號(hào)的亞細(xì)胞定位(如細(xì)胞膜、細(xì)胞核、線粒體)。
關(guān)鍵指標(biāo):熒光強(qiáng)度、陽(yáng)性細(xì)胞比例、信號(hào)分布區(qū)域(結(jié)合細(xì)胞器標(biāo)記物如MitoTracker,可定位互作發(fā)生的具體位置)。
(2)定量分析方法
流式細(xì)胞術(shù):統(tǒng)計(jì)熒光陽(yáng)性細(xì)胞占比,定量互作效率。
時(shí)間分辨成像:動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)隨時(shí)間的變化(如信號(hào)出現(xiàn)的時(shí)間窗口、強(qiáng)度峰值)。
三、BiFC技術(shù)的“優(yōu)勢(shì)與局限”:何時(shí)選擇這項(xiàng)技術(shù)?
1. 核心優(yōu)勢(shì):活細(xì)胞內(nèi)的“直觀可視化”
(1)無(wú)需裂解細(xì)胞,保留天然環(huán)境
直接在活細(xì)胞中觀察,避免傳統(tǒng)Co-IP(免疫共沉淀)需裂解細(xì)胞的局限,反映真實(shí)生理?xiàng)l件下的互作。
(2)亞細(xì)胞定位精準(zhǔn)
可結(jié)合細(xì)胞器特異性標(biāo)記(如核定位信號(hào)NLS、線粒體靶向肽),確定蛋白質(zhì)互作發(fā)生的具體位置(如“蛋白A和B僅在細(xì)胞核內(nèi)互作”)。
(3)高靈敏度檢測(cè)弱互作
即使是瞬時(shí)或低親和力的互作(如信號(hào)通路中激酶與底物的短暫結(jié)合),也可通過(guò)熒光信號(hào)的累積效應(yīng)被檢測(cè)到。
(4)多色BiFC:同時(shí)觀察多對(duì)互作
使用不同熒光蛋白片段(如YFP-VN/VC檢測(cè)A-B互作,mCherry-VN/VC檢測(cè)C-D互作),可在同一細(xì)胞內(nèi)觀察多組蛋白質(zhì)互作,解析復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。
2. 技術(shù)局限:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)需規(guī)避的“陷阱”
(1)熒光不可逆:無(wú)法反映動(dòng)態(tài)解離
一旦VN和VC重組形成熒光蛋白,即使目標(biāo)蛋白A/B解離,熒光仍持續(xù)存在,無(wú)法實(shí)時(shí)追蹤互作的“解離”過(guò)程。
(2)假陽(yáng)性風(fēng)險(xiǎn):片段可能自發(fā)重組
少數(shù)熒光蛋白片段(如YFP)在高表達(dá)時(shí)可能自發(fā)互補(bǔ),需通過(guò)嚴(yán)格陰性對(duì)照(如單獨(dú)轉(zhuǎn)染VN/VC片段)排除。
(3)熒光強(qiáng)度低:需長(zhǎng)時(shí)間觀察
片段重組效率低(約10%-30%),熒光信號(hào)弱,可能需要延長(zhǎng)曝光時(shí)間或使用高靈敏度顯微鏡。
(4)干擾目標(biāo)蛋白功能
熒光片段(約20kDa)可能改變目標(biāo)蛋白的構(gòu)象或活性,需通過(guò)功能實(shí)驗(yàn)(如過(guò)表達(dá)野生型與融合蛋白的表型對(duì)比)驗(yàn)證。
四、應(yīng)用場(chǎng)景:從基礎(chǔ)研究到疾病機(jī)制
BiFC技術(shù)已廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)互作驗(yàn)證、信號(hào)通路解析、病毒-宿主互作等領(lǐng)域,以下為典型案例:
1. 蛋白質(zhì)互作驗(yàn)證:從“預(yù)測(cè)”到“眼見(jiàn)為實(shí)”
案例:驗(yàn)證擬南芥生長(zhǎng)素受體TIR1與Aux/IAA蛋白的互作。將TIR1與VN融合,Aux/IAA與VC融合,共轉(zhuǎn)染煙草葉片細(xì)胞后,在生長(zhǎng)素處理下觀察到細(xì)胞核內(nèi)熒光信號(hào),證明二者在核內(nèi)發(fā)生配體依賴性互作。
2. 信號(hào)通路動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè):捕捉互作的“時(shí)間窗口”
案例:研究MAPK信號(hào)通路中激酶MEK與ERK的激活互作。BiFC實(shí)驗(yàn)顯示,EGF刺激后5分鐘,細(xì)胞質(zhì)中出現(xiàn)MEK-ERK互作熒光信號(hào),30分鐘后信號(hào)轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核,揭示互作的時(shí)空動(dòng)態(tài)。
3. 病毒-宿主互作:病毒蛋白如何“劫持”宿主因子
案例:HIV病毒Vif蛋白通過(guò)結(jié)合宿主APOBEC3G(抗病毒蛋白)使其降解。BiFC實(shí)驗(yàn)顯示,Vif-VN與APOBEC3G-VC共表達(dá)時(shí),在細(xì)胞質(zhì)中產(chǎn)生熒光信號(hào),證明二者直接互作,為抗病毒藥物設(shè)計(jì)提供靶點(diǎn)。
4. 多蛋白復(fù)合體組裝:解析“分步結(jié)合”機(jī)制
案例:用多色BiFC研究DNA修復(fù)復(fù)合體(如Ku70/Ku80/DNA-PKcs)的組裝順序。紅色熒光標(biāo)記Ku70-Ku80互作,綠色熒光標(biāo)記Ku80-DNA-PKcs互作,發(fā)現(xiàn)紅色信號(hào)先出現(xiàn)(Ku70-Ku80結(jié)合),隨后綠色信號(hào)出現(xiàn)(招募DNA-PKcs),揭示復(fù)合體組裝的時(shí)空順序。